Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nudt21Q9CQF3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms