Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RTRAFQ9CQE8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RTRAFQ9CQE8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTRAFQ9CQE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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