Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CQC3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CQC3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQC3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CQC3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms