Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Med4Q9CQA5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med4Q9CQA5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms