Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpa3Q9CQ71 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpa3Q9CQ71 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms