Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nudcd2Q9CQ48 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms