Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NenfQ9CQ45 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NenfQ9CQ45 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms