Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Commd4Q9CQ02 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Commd4Q9CQ02 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms