Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg3Q9CPX6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg3Q9CPX6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms