Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nop16Q9CPT5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nop16Q9CPT5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms