Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt88Q9CPR6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt88Q9CPR6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms