Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim26Q99PN3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim26Q99PN3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms