Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rassf3Q99P51 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rassf3Q99P51 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms