Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bco2Q99NF1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bco2Q99NF1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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