Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vgll1Q99NC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll1Q99NC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms