Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sf3b1Q99NB9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3b1Q99NB9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sf3b1Q99NB9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms