Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf17Q99MV7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rnf17Q99MV7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf17Q99MV7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms