Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sh3bp5lQ99LH9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sh3bp5lQ99LH9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms