Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TriobpQ99KW3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TriobpQ99KW3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms