Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GatbQ99JT1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GatbQ99JT1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms