Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddb2Q99J79 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddb2Q99J79 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms