Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Apobec3Q99J72 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apobec3Q99J72 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms