Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smim11aQ99J19 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smim11aQ99J19 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms