Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Letmd1Q924L1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Letmd1Q924L1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms