Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Csmd1Q923L3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Csmd1Q923L3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Csmd1Q923L3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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