Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nrif1Q923B3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nrif1Q923B3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms