Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf3Q922U1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf3Q922U1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms