Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarca5Q91ZW3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms