Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atpaf2Q91YY4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atpaf2Q91YY4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms