Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Basp1Q91XV3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Basp1Q91XV3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms