Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Creb3l3Q91XE9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Creb3l3Q91XE9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms