Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nsmce2Q91VT1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nsmce2Q91VT1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms