Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hps3Q91VB4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hps3Q91VB4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms