Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cabp4Q8VHC5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cabp4Q8VHC5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cabp4Q8VHC5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms