Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srsf4Q8VE97 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf4Q8VE97 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms