Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fyco1Q8VDC1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fyco1Q8VDC1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fyco1Q8VDC1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms