Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt25Q8VCW2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt25Q8VCW2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms