Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc12Q8R344 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms