Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trim29Q8R2Q0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trim29Q8R2Q0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms