Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg10Q8R1P4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms