Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RorbQ8R1B8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms