Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CipcQ8R0W1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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CipcQ8R0W1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CipcQ8R0W1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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