Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms