Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxc12Q8K5B8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hoxc12Q8K5B8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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