Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q6

Neil1, Endonuclease 8-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil1Q8K4Q6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Neil1Q8K4Q6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms