Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
Hecw1Q8K4P8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hecw1Q8K4P8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms