Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OptnQ8K3K8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OptnQ8K3K8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms