Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrtm1Q8K377 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrtm1Q8K377 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms