Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Ssh3Q8K330 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ssh3Q8K330 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Ssh3Q8K330 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ssh3Q8K330 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms