Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ncapd2Q8K2Z4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms